поумнеть

Плоды дуба

Поправьте где гоню.

жёлудь на дубе развивается не из материнских, а из дочерних клеток.
генотип "мякоти" желудя 50/50 материнский/отцовский.
ген горечи есть не у всех - бывают сладкие желуди.
но по причине вот такой вот генетики, для получения сладкого урожая надо перебить все горькие дубы в округе.

и да, ген горечи рецессивный или доминантный?

Высокопроизводительное секвенирование в геномике

Оригинал взят у fp7_bio_ru в Высокопроизводительное секвенирование в геномике

Глубокоуважаемые коллеги!


С 18 по 23 июня 2017 г. Институт химической биологии и фундаментальной медицины СО РАН совместно с Институтом молекулярной и клеточной биологии СО РАН проводят всероссийскую конференцию "Высокопроизводительное секвенирование в геномике".
Геномное секвенирования открыло новую эру в биологии, позволив исследователям получать и анализировать огромные массивы данных. В программе конференции будут представлены пленарные и секционные доклады в таких областях как геномика эукариот и прокариот, метагеномика сообществ микроорганизмов, палеогеномика и медицинская геномика, белок-нуклеиновые взаимодействия (CLIP-seq) и трансляция (Ribo-seq).
Приглашаем Вас принять участие в Международной конференции «Высокопроизводительное секвенирование для геномики».
Контакты: hsg@niboch.nsc.ru

Важные даты
До 15 апреля – скидка на оргвзнос;
До 1 мая – прием тезисов;
До 15 мая - извещение о принятии тезисов и форме доклада;
До 15 мая – стандартный оргвзнос;
До 15 июня – оплата орг. взноса;
18 июня – начало работы конференции;
23 июня – закрытие конференции.

Подробнее: http://conf.nsc.ru/HSG2017/ru

73-е Баховское чтение

Оригинал взят у fp7_bio_ru в 73-е Баховское чтение

17 марта (пятница) в 15:00 состоится 73-е Баховское чтение в конференц-зале Института биохимии имени А.Н.Баха.

академик В.Т. ИВАНОВ
«ЭНДОГЕННЫЕ ПЕПТИДЫ — «ТЁМНАЯ МАТЕРИЯ» ПРОТЕОМА»

Быстрое развитие современных аналитических методов, в первую очередь высокоэффективной жидкостной хроматографии и времяпролётной масс-спекрометрии в сочетании с доступностью многочисленных геномных последовательностей резко расширило в последние годы возможности тотального скрининга биологического материала на присутствие биомолекул любого класса.

В предлагаемой лекции будет рассмотрено современное состояние одного из таких направлений, пептидомики, т.е. системного структурного и функционального анализа эндогенных пептидов в биологических образцах.

Будет показано, что количество обнаруженных пептидов с установленной первичной структурой резко увеличивается с повышением чувствительности анализа и достигает в растительных и животных образцах уровня десятков тысяч. Установлено, что эндогенные пептиды образуются как путём протеолиза белковых предшественников, так и прямой трансляцией коротких рамок считывания.

Будут рассмотрены возможности биомедицинского применения пептидомного анализа – для диагностических целей и для определения молекулярных механизмов патогенеза. Будет показано, что белки микробной флоры дают существенный вклад в суммарный пептидом крови человека.

Серьёзным препятствием для применения пептидомного анализа в медицинской диагностике является отсутствие приемлемых методов количественного масс-спектрометрического анализа содержания пептидов в изучаемых образцах. Приводятся примеры функциональной активности отдельных обнаруженных пептидов, хотя системный анализ биологической роли компонентов пептидных пулов остаётся ещё не решённой проблемой.


Пригласительный билет на 73-е Баховское чтение

Плакат-объявление 73-е Баховское чтение


Место проведения:
119071 г. Москва, Ленинский проспект, дом 33, стр. 2.
Институт биохимии имени А.Н.Баха ФИЦ Биотехнологии РАН (конференц-зал)

Биоинформатик для участия в проекте РНФ (Москва)

В лабораторию Клинической генетики НЦПЗ нужен биоинформатик (выпускник, студент ФББ МГУ) для работы с эпигенетическими данными (анализ результатов ATAC-seq). Эта работа в планируемом проекте. Нужно уважение к дэдлайнам и объяснять суть работы не вполне математематически-одаренным коллегам. Оплата по договору, примерно 150 тысяч рублей в год.
Nikolay (n.kondratiev)
Научный центр психического здоровья, лаб. Клинической генетики
Москва
http://www.biohab.ru/index.php?/topic/8164-биоинформатик-для-участия-в-проекте-рнф-москва/

Мир биотехнологии 2017

Оригинал взят у fp7_bio_ru в Мир биотехнологии 2017
Биотехнология: состояние и перспективы развития
Международная специализированная выставка
Мир биотехнологии 2017
20-22 февраля 2017
Москва, Гостиный Двор, Ильинка, 4
http://www.biomos.ru/index.htm

Биоинформатик на микробиомы (Сингапур)

Постдок во Франции

Are you a creative, motivated, and talented researcher with a background in mathematics, computer science, quantitative biology or operations research? Do you have an interest in making a difference in infectious disease research? Then this is the opportunity for you!

Our group explores a range of problems centred around the study of infectious disease genomes. Our projects straddle computational and systems biology, epidemiology, and public health policy; our current projects include:

- an integrative analysis of genomic markers (SNPs, copy numbers, MLST, rearrangements), with the goal of identifying epidemiologically-related strains during a bacterial outbreak

- analysis and visualization of genetic, geographic and temporal patterns in an outbreak, with the goal of identifying transmission hotspots and risk factors for tuberculosis

- identification and dynamical modelling of bacterial diversity within ticks, with the goal of understanding the ecological processes driving the evolution of Lyme disease pathogens

Our North American collaborators include the British Columbia Centre for Disease Control (BC CDC), the British Columbia Centre for Excellence in HIV/AIDS (BC-CfE), and the New York City Department of Health and Mental Hygiene (NYC DOHMH). We also collaborate internationally with groups in the United Kingdom, France, Germany, India, China and South Africa.

A complete application should include a statement of interest, a CV, the names of 3 references, and a link to the repository of a programming project you took part in. Please submit applications to Leonid Chindelevitch, leonid@sfu.ca, with “Postdoctoral fellowship” in the subject line. All applications will be considered; preference is given to Canadian citizens or permanent residents. The starting date is September 1st, 2016, and the position will remain open until filled.

http://www.biohab.ru/index.php?/topic/6782-postdoctoral-fellowship-france-ecole-polytechnique/

Open call for research fellowships in Systems Biology

Оригинал взят у fp7_bio_ru в Open call for research fellowships in Systems Biology

Skoltech Research, Education, and Innovation Center for Data Intensive Biomedicine and Biotechnology is proud to announce an open call for research fellowships in Systems Biology – the first such program in Russia. The program is made possible through a generous support from Philip Morris Sales and Marketing. This competitive program is open to advanced graduate students and recent postdocs from Russian higher education establishments and research institutions.

The program is coordinated by Drs. Mikhail Gelfand (Moscow State University and Institute of Russian Academy of Sciences Information Transmission Problems) and Philip Khaitovich (Skoltech). A transparent procedure involving international scientific expertise will be implemented to select best proposals for three-year support of basic research in the broad field of systems biology and data-intensive biology that is in the main focus of biomedical research at Skoltech. Up to five winners will be announced in April of 2016 by the Board, which consists of Prof. Manuel C Peitsch, the Chief Scientific Officer of Philip Morris International, and Konstantin Severinov, Director of Skoltech Center for Data Intensive Biomedicine and Biotechnology. In addition to support for their projects award recipients will be provided with mentorship opportunities through networking with best Russian and international scientists in the field.

Program Applicants shall meet the following criteria:

* be a post graduate or a young researcher without a degree, but no older than 30 years of age as of the date of receipt of Application, or have PhD, MD or equivalent degree, but no older than 35 years of age, with defended no earlier than 3 (Three) years prior to receipt of Application.

If a female-Applicant has a child (children) born within 3 (Three) years after defence of a dissertation, the term of filing of  Application for the Program will be extended for 1 (One) year for each child born during this period.

More

FACULTY POSITIONS IN SKOLTECH CENTER FOR DATA-INTENSIVE BIOMEDICINE AND BIOTECHNOLOGY

Оригинал взят у fp7_bio_ru в FACULTY POSITIONS IN SKOLTECH CENTER FOR DATA-INTENSIVE BIOMEDICINE AND BIOTECHNOLOGY
FACULTY POSITIONS IN SKOLTECH CENTER FOR DATA-INTENSIVE BIOMEDICINE AND BIOTECHNOLOGY

Skoltech Center for Data-Intensive Biomedicine and Biotechnology (CDIB) of the Skolkovo Institute of Science and Technology (Skoltech, Moscow, Russia) is looking for faculty members to be appointed at Assistant/Associate/Full Professor level. Specifically, we are looking for candidates who will establish a high-quality interdisciplinary research program in bioinformatics and/or systems biology.

The faculty positions are available starting in 2016. Please apply by August 31, 2015, at http://join.skoltech.ru/.

Applicants at the level of Assistant Professor should have a PhD or similar degree(s), considerable post-doctoral experience, a demonstrated high level of productivity and evidence of the ability to develop an independent and interactive research program. Applicants at the level of Associate orFull Professor should also have a demonstrated capacity to sustain high-quality research and a consistent and significant publication record.

More

Омиксные данные: получение и использование в медицинских приложениях

Оригинал взят у fp7_bio_ru в Омиксные данные: получение и использование в медицинских приложениях
ЦНИО Системной биомедицины и биотехнологии Сколковского института науки и технологий (http://crei.skoltech.ru/cdib/) проводит прием заявок на участие в образовательном курсе по получению омиксных данных и их использованию в медицинских приложениях.

Данный курс является продолжением цикла практических курсов Сколтеха и Фонда инфраструктурных и образовательных программ РОСНАНО (Анализ геномных данных http://biologica.org/project/genomic-data-analysis/ и Анализ данных в нейронауках http://biologica.org/project/neuroscience-data/).
В программу курса по анализу омиксных данных включены обзорные лекции по технологиям, методологические лекции по вычислениям, описанию приложений и практики их применения. Также в программе интенсивные индивидуальные практические занятия в компьютерном классе и групповые обсуждения с лекторами курса. Курс пройдет 20–27 июля 2015 года.

Расписание курса доступно по ссылке: http://biologica.org/omics-data-program/
Преподавательский состав: Felix Agakov (Pharmatics company), Emmanuel Barillot (Institut Curie), Valentina Boeva (Institut Curie), Vadim Gladyshev (Harvard Medical School), Evgeny Imyanitov (St.-Petersburg Pediatric Medical Academy), Alexander Kanapin (Oxford University), Lennart C. Karssen (PolyOmica), Philipp Khaitovich (CAS-MPG, Skoltech), Peter Kharchenko (Harvard Medical School), Maria Kondratova (Institut Curie), Ekaterina Kotelnikova (August Pi i Sunyer Biomedical Research Institute), Ivan Kulakovsky (Engelhardt Institute of Molecular Biology; Vavilov Institute of General Genetics RAS), Manja Marz (Fredrich-Schiller-Universität Jena), Tatiana Popova (Institut Curie), Mikhail Pyatnitskiy (Orekhovich Institute of Biomedical Chemistry, RAS), Dmitry Ravcheev (Luxembourg Centre for Systems Biomedicine), Andrei Zinovyev (Institut Curie)
Слушатели отбираются преподавателями курса на конкурсной основе. Рабочий язык курса — английский. Стипендиальный фонд, пополнившийся спонсорской помощью, позволяет оказать поддержку слушателям. Требования к слушателям и условия подачи заявки на http://biologica.org/project/omics-data/.